物質界 巡洋艦ヴォークリンデ・KOS−MOS調整室
零児＆小牟は、第１６話開始時の選択肢で「KOS−MOS調整室へ行く」を選んでいた場合のみ登場。
味方キャラクター
フーバー 登場作品：カプコン「キャプテンコマンドー」 ベビーコマンドーと呼ばれる、コマンドーチームの一員。
赤ん坊だが優れた知能を持っており、情報分析や兵器開発から
コマンドーチームの参謀的な役割も担う。
乗機「シルバーフィスト」も、彼が自作したものである。ジェネティー 登場作品：カプコン「キャプテンコマンドー」 マミーコマンドーと呼ばれる、コマンドーチームの一員。
全身包帯に包まれた謎の人物…その正体は異星人である。
まったく言葉を発しないが、意思の疎通は可能のようである。
敵を溶解させる、特殊な薬品が塗られた２本のナイフで戦う。（既出キャラクター） ガイ＆ショウ、（零児＆小牟）、シオン＆M．O．M．O．、
ベラボーマン＆ワンダーモモ、レイレイ＆鳳鈴、ケン、
モリガン、トロンにコブン
敵キャラクター
| キャノンポッター | 登場作品：ナムコ「ワンダーモモ」 |
| ミュージカル“ワンダーモモ”の劇中に登場する、怪人軍団 ワルデモンの戦闘員で、バズーカを持った怪人。 | |
| リリス | 登場作品：カプコン「ヴァンパイアシリーズ」 |
| モリガンに似た格好をした少女。 強い魔力、そして使う技もモリガンとよく似ている。 “本当の体”に戻りたいと、謎めいた事を話す。 モリガンと何らかの関係があるようだが…？ | |
| フェアリー | 登場作品：ナムコ「ゼノサーガ エピソードI」 |
| 人類に対して敵対行動をとるという事実以外、全てが謎に 包まれている、グノーシスと呼ばれる謎の存在。 実在事象と異なる領域に存在し、通常は触れる事ができない。 フェアリーは飛行能力を持ち、雷系の攻撃を得意とする。 | |
| （既出キャラクター） | ザベル、アマゾーナ、クラブフェンサー、ヴェロキラプトル、 沙夜、毒牛頭、毒馬頭、ブラックベラボー、わや姫、悪天狗、 ゴブリン、ゴーレム |